１３日午後９時半ごろ、大阪・関西万博の会場につながる唯一の鉄道路線、大阪メトロ中央線で電気系統のトラブルが発生し、運転を見合わせた。大勢の来場者とスタッフが帰宅できなくなり、会場内で一夜を過ごした。中央線は１４日早朝に全線で運転を再開。日本国際博覧会協会（万博協会）は１４日の開場を１時間遅らせ、午前１０時にすると発表した。
会場内では１３日深夜、複数のパビリオンが休憩用に開放された。来場者が帰宅できない事態と、開場を遅らせるのは、いずれも４月１３日の開幕以来初めて。
大阪市消防局と大阪府警によると、１４日朝までに気分不良や熱中症の疑いで３６人が救急搬送された。いずれも軽症という。警察官が駅周辺の雑踏警備や会場内の警戒に当たり、大きなトラブルはなかった。
中央線は８月１３日夜、コスモスクエア（大阪市住之江区）―阿波座（同市西区）間で運転を見合わせ、会場東ゲートに直結する夢洲駅に来場者が集中、一時構内への入場を規制した。