大型で非常に強い台風１３号は３日、南鳥島近海を西寄りに進んだ。４日に小笠原諸島に最も接近するため、気象庁は５日にかけてうねりを伴った高波や暴風に警戒するよう呼びかけている。７日には強い勢力で南西諸島へ進む見込みで、沖縄・奄美は５日から大荒れの天気になり、進路によっては警報級の大雨や高潮となる恐れがある。
気象庁によると、台風１３号は３日午前６時現在、南鳥島近海を時速２５キロで西北西に進んだ。中心気圧は９４０ヘクトパスカルで、最大風速は４５メートル、最大瞬間風速は６５メートル。中心から半径１８５キロ以内は風速２５メートル以上の暴風域となっている。
小笠原諸島で予想される波の高さは、３日は８メートル、４日は１１メートル、５日は９メートルでいずれもうねりを伴う。最大風速（最大瞬間風速）は、３日は２０メートル（３０メートル）、４日は２５メートル（３５メートル）。５日午前６時までに予想される２４時間降水量は多い所で１２０ミリ、その後の２４時間は８０ミリ。